Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gli1P47806 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gli1P47806 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gli1P47806 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms