Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt1P46096 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms