Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms