Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a2P43006 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a2P43006 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms