Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3caP42337 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms