Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms