Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LtbP41155 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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