Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TfamP40630 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TfamP40630 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TfamP40630 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TfamP40630 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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