Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThpoP40226 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ThpoP40226 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms