Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms