Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HmgclP38060 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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