Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lig1P37913 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lig1P37913 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lig1P37913 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms