Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PpargP37238 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PpargP37238 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms