Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms