Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn11P35235 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms