Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms