Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms