Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp13P33435 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms