Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms