Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch4P31695 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch4P31695 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms