Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms