Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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