Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms