Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprmP28828 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprmP28828 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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