Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms