Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LoxP28301 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms