Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms