Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms