Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U2af2P26369 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms