Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CftrP26361 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CftrP26361 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CftrP26361 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CftrP26361 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CftrP26361 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms