Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms