Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms