Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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