Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms