Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prim1P20664 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prim1P20664 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms