Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms