Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms