Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TP20293 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TP20293 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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