Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms