Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms