Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NefhP19246 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NefhP19246 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NefhP19246 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NefhP19246 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NefhP19246 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NefhP19246 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms