Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PtpraP18052 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpraP18052 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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