Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms