Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms