Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms