Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Msx1P13297 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx1P13297 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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