Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms