Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms