Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sbk3P0C5K0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sbk3P0C5K0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms