Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb1P09055 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms